平成１１年度のＳｔ２５（東京灯標）のデータ−を例に水質の季節変化を見ると以下の通りである。
（１）、成層期と循環期
図−６に水温の季節変化を、図−７に水温等の８月の垂直分布を示した。夏季に暖かい上層と冷たい下層ができる（成層期）。冬季は上層が冷たくなり、比重の関係で上下層の循環が起こる（循環期）。
 図ー６ 水温の季節変化 |
 図ー７ ８月の垂直分布（水温等 |
（２）、プランクトンの異常増殖
６月には成層が出来て上下層の循環が少なくなり、日射が強くなる結果プランクトンの異常増殖が起こる。赤潮の発生である。クロロフィルの増大、上層のＤＯの過飽和、ＣＯＤの上昇が起こる。
 図−８ クロロフィルの季節変化 |
 図−９ ＤＯの季節変化 |
 図−１０ ＣＯＤと透明度の季節変化 |
（３）、窒素、燐の形態変化
図−１１に窒素の図−１２に燐の形態別季節変化を載せた。６月は有機体窒素、有機体燐が多くなる。これは、プランクトンの異常増殖で海水中の窒素、燐より、プランクトン中の窒素、燐が高くなっているためである。
 図ー１１ 窒素の季節変化 |
 図ー１２ リンの季節変化 |
（４）貧酸素水塊
図−９に見られるように、貧酸素水塊は春と秋に発生し、特に９、１０月に大きく広がり、下層では燐の溶出が見られる。
（図−１３下層の燐の季節変化）