| 監督 | 加 藤 久 |
| コーチ | 上 野 展 裕 |
| コーチ | 秋 田 豊 |
| ＧＫコーチ | 森 下 申 一 |
| フィジカルコーチ | 吉 満 樹 |
| 1 | GK | 平 井 直 人 | ||||
| 2 | MF | アタリバ | 2008年度にて契約満了 | |||
| 3 | DF | シジクレイ | ||||
| 4 | DF | 中 谷 勇 介 | ||||
| 5 | DF | 手 島 和 希 | ||||
| 6 | DF | 森 岡 隆 三 | ||||
| 7 | FW | 徳 重 隆 明 | 2008年度にて契約満了⇒徳島ヴォルティス | |||
| 8 | MF | 倉 貫 一 毅 | 6月11日 契約解除 6月23日 徳島ヴォルティスへ移籍 |
MF | 水 本 裕 貴 | 6月22日 ガンバ大阪より完全移籍 |
| 9 | FW | 田 原 豊 | 2008年度にて契約満了⇒湘南ベルマーレ | |||
| 10 | FW | パウリーニョ | 怪我により選手登録抹消 | MF | フェルナンジーニョ | 6月9日 清水エスパルスより期限付き移籍⇒移籍期間満了 |
| 11 | FW | 林 丈 統 | ||||
| 12 | SP | サポーター | ||||
| 13 | FW | 柳 沢 敦 | ||||
| 14 | MF | 佐 藤 勇 人 | ||||
| 15 | MF | 中 山 博 貴 | ||||
| 16 | MF | 斉 藤 大 介 | ７月14日 ベガルタ仙台へ期限付き移籍⇒ベガルタ仙台へ完全移籍 | |||
| 17 | MF | 石 井 俊 也 | 2008年度にて契約満了⇒ロアッソ熊本 | |||
| 18 | MF | 安 藤 淳 | ||||
| 19 | DF | 登 尾 顕 徳 | 2月20日 徳島ヴォルティスへ期限付き移籍⇒2008年度にて契約満了⇒徳島ヴォルティスへ完全移籍 | |||
| 20 | MF | 平 島 崇 | ７月14日 セレッソ大阪へ期限付き移籍⇒2008年度にて契約満了⇒セレッソ大阪へ完全移籍 | |||
| 21 | GK | 水 谷 雄 一 | ||||
| 22 | MF | 渡 邉 大 剛 | ||||
| 23 | DF | 大久保 裕 樹 | 2008年度にて契約満了⇒栃木SC | |||
| 24 | DF | 増 嶋 竜 也 | ⇒2009年度より完全移籍 | |||
| 25 | FW | 西 野 泰 正 | ||||
| 26 | DF | 角 田 誠 | ||||
| 27 | MF | 加 藤 大 志 | 2008年度にて契約満了⇒横浜FC | |||
| 28 | MF | ウィリアムス | 2009年度佐川印刷ＳＣへ期限付き移籍 | |||
| 29 | MF | 中 村 太 亮 | ||||
| 30 | MF | 加 藤 弘 堅 | ||||
| 31 | FW | 宮 吉 拓 実 | ||||
| 32 | ||||||
| 33 | GK | 上 野 秀 章 | 2009年度 徳島ヴォルティスへ移籍 | |||
| MF | 三 戸 雄 志 | 1月22日 MIOびわこ草津へ期限付き移籍⇒グルージャ盛岡（東北社会人リーグ） | ||||
| FW | 隅 田 航 | 1月22日 V・ファーレン長崎へ期限付き移籍⇒V・ファーレン長崎(JFL)へ完全移籍 | ||||
| MF | 姜 鉱 守 | 1月23日 カターレ富山へ期限付き移籍⇒カターレ富山へ完全移籍 | ||||
| DF | 田 村 仁 崇 | 1月 栃木ＳＣへ期限付き移籍⇒栃木ＳＣへ完全移籍 | ||||